Siedzibą Oddziału Krakowskiego Polskiego Towarzystwa Studiów Europejskich jest Kraków. 

WŁADZE ODDZIAŁU KRAKOWSKIEGO PTSE

Zarząd:

• Prezes – dr Mirosław Natanek (Instytut Studiów Europejskich, Uniwersytet Jagielloński)

• Wiceprezes – dr Agnieszka Nitszke (Instytut Nauk Politycznych i Stosunków Międzynarodowych, Uniwersytet Jagielloński)
• Sekretarz - prof. UJ dr hab. Krzysztof Koźbiał (Instytut Studiów Europejskich; Uniwersytet Jagielloński)

• Skarbnik - dr Natasza Styczyńska (Instytut Studiów Europejskich, Uniwersytet Jagielloński)
• Członek Zarządu - dr Wojciech Burek (Instytut Studiów Europejskich; Uniwersytet Jagielloński)

Komisja Rewizyjna:

• Przewodniczący - dr Magdalena Zajączkowska (Katedra Europejskiej Integracji Gospodarczej; Uniwersytet Ekonomiczny w Krakowie)
• Wiceprzewodniczący - dr Marcin Zubek (Instytut Studiów Europejskich; Uniwersytet Jagielloński)
• dr Marcin Galent (Instytut Studiów Europejskich; Uniwersytet Jagielloński)